空被黑雲遮蓋，地表已經見不到陽光。人類研發的母體機器人，把所有人類都關押到培養艙圈養起來。人類身上從出生開始，就被安裝上了眾多插頭，連接著管線，當做機器人的電磁。
人類被機器人，當做能源電池圈養著。
這些被圈養的人，他們並不知道真實世界那殘酷的現實，這些人類的思維，都被投入到矩陣的虛擬世界中生存。
主角尼奧是第六個救世主，是機器人母體根據人類缺陷被選定和賦予的救世主身份。
機器人母體，準備利用救世主來清除和彌補矩陣推演過程中，出現的一系列不穩定因素。
不過中間發生了些意外，史密斯特工這機器人子程序徹底脫離母體，並擁有了類似電腦病毒的強大感染的能力，要危害到母體的存在。
最終主角尼奧用擊殺史密斯為條件，與機器人母體成功和談，讓人類可以自由選擇是留在矩陣世界繼續當機器人的電池，還是回到殘酷的末日現實世界真正的活著。
原著中，主角尼奧是用了自我犧牲的方式，讓脫離機器人母體程序控制的史密斯，感染了他在矩陣中的身體。
史密斯感染尼奧後，才驚恐的發現他自身又重新與母體連接上了，他隨後被母體清除掉了。
雷克想著，如果不存在尼奧這主角，他和小女王是救世主的話，是否也要至少其中一人犧牲。
當然，史密斯這脫離母體的機器人子程序的出現，在原著中也是主角尼奧第一次覺醒時，對其徹底擊殺後觸發的偶然事件。
要是這副本世界救世主尼奧不存在，就算史密斯特工這子程序機器人存在，自己和小女王估計也沒辦法史密斯這子程序脫離母體，成為類似電腦病毒的存在。
雷克想著想著，自己也睡著了，現在分析真是太複雜了，還是像和小女王剛剛定的那樣，等完成主線任務2，他和小女王去往上層真實世界再考慮吧。
第二天六點多，小女王就用龍騎士心靈溝通能力，給雷克腦中發來了她唱的歌聲，把雷克叫醒了。
「你這比鬧鈴還吵啊，還關不了，龍騎士有你這種龍，絕對是它們的恥辱！」雷克回復抱怨著小女王。
雷克只能起來洗漱，隨後去餐廳和小女王用早餐。
