廠、那霸支隊、台灣支隊以及大陳島、南日島被編入華昌貿易公司。所有的服役和在建戰艦以及歸屬貿易公司的商船。和各種大小福建船，作價一百五十萬兩。各個基地港口、造船廠聯通土地加在一起折算約為八十萬兩，所有的技術工匠、船隊頭領以及軍士長以上將官入乾股七十萬兩，囤積在各地倉庫等待出售的貨物估價五十萬兩，再加上毛鈺從京城帶來的一百萬兩現銀。華昌貿易公四總資產四百五十萬兩。其中毛鈺占股兩百四十萬兩。大陳島和南日島獨立核算，屬於子公司性質。但南日島造船廠屬於華昌貿易公司直接控制。除了毛鈺和朱由檢、曹化淳、完成恩、周奎、田宏遇等大股東外，曾立剛和李守信因為土地折算和船隻折算成為了小股東之中比較靠前的兩位，和尚可喜、達代應、孔有德、毛永傑等位列同一個檔次。
華昌公司實行公司化運作之後，戰艦護航是需要向毛鈺支付費用的，隨戰艦船將士的薪水在護航旗艦也同樣需要華昌貿易承擔。
金塘島則依舊只屬於毛鈺個人的獨立王國，負責各種先進裝備的研發和製造。負責各類高級人才的培訓和培養，以及面對全體成員的基礎福利。對外出租裝備、技術和人才、為貿易公司提供護航，為海軍衙門提供戰力。
當然公司化獨立核算並不等於分家，包括各支隊在內，戰艦屬於毛鈺，商船屬於華昌貿易，戰兵屬於金塘島或者海軍衙門，水手則大部分屬於華昌貿易。
當然毛鈺也有言在先，除了平時按照股東大會和董事會決議運行三大塊之外，遇到戰事必須全部接受海軍衙門也就是毛鈺本人的統一指揮。
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