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瑞士某個偏遠山區之中，有著一個不為人知的科研基地。
在科研基地的房間之中，佐拉博士來回走動著，那圓框鏡片下閃爍著興奮的光芒，因為他剛剛收到消息，他等待七十多年的首領回來了。
「佐拉博士，好久不見。」，這個時候，一道冷清的聲音就傳進佐拉博士的耳中。
聽到這聲音，佐拉博士先是一愣，隨後露出狂喜的神色。
猛地轉身，果不其然，一個熟悉的面孔映入他眼中。
「首領！你回來了！」，佐拉博士一臉激動的看著葉思雨說道。
「是的，我回來了。」，葉思雨點了點頭。
「實在是太好了！我們終於可以解決那些叛徒了！」佐拉博士興奮地說道。
「叛徒？」，聽到佐拉博士的話，葉思雨的臉上就露出疑惑的神色。
「是的，首領，我們出現叛徒了，他們……」，佐拉博士激動地說道，將葉思雨離開的這七十年時間中九頭蛇發生的變化全部告訴給葉思雨知道。
「原來如此，辛苦你了，佐拉博士。」，聽到佐拉博士的訴說，葉思雨大概的理清楚自己離開這段時間漫威電影宇宙位面的歷史。
在他離開後，佐拉博士帶著殘存下來的九頭蛇加入到戰略科學軍團，開始的時候還好，但在神盾局這個龐大的部門成立後就出現問題了。
nazi-hydra，也就是紅骷髏所創造的九頭蛇只不過是紅骷髏追隨歷代九頭蛇理念創立的，並非正統的九頭蛇，除此以外，還有許許多多個九頭蛇分支。
這些分支在得知佐拉博士領導的nazi-hydra九頭蛇組織即將掌握神盾局的時候就眼紅了，不少分支試圖從佐拉博士手上獲取權利。
這些無禮的要求都被佐拉博士拒絕了，只是這些九頭蛇分支並不是好惹的，更不要說佐拉博士僅僅是一個科研人員，並不擅長組織發展。
再加上佐拉博士是聽命於葉思雨的，除了掛著一個九頭蛇的名字外，與九頭蛇沒有多大瓜葛
在nazi-hydra九頭蛇加入戰略科學軍團後他就一直專心於科研以及等待葉思雨的回歸，對於權利什麼的並不怎麼關心，所以那些九頭蛇分支就聯合那些同樣不喜歡佐拉博士領導得到九頭蛇成員趁虛而入。
將原本屬於佐拉博士的權利全部奪取過來，要不是葉思雨在離開前給了佐拉博士一些保命道具，他可能會喪命於這一次奪權危機之中。
遭遇了這一擊危機後，佐拉博士就帶著殘存的部下隱藏起來，如非必要都不會離開基地，而是專心致志的留在基地為葉思雨的回歸而做準備。
「這些都是值得的，首領萬歲！」，佐拉博士神情火熱的說道，現在葉思雨回來了，那些九頭蛇分支都不會是他們的對手，所有的一切他們都能夠重新拿回自己手中。
「佐拉博士，為何我離開前給你的人工智慧會在神盾局總部？」，在了解了一些大概情況後，葉思雨就詢問出自己的疑惑。
要知道子系統是他給了佐拉博士的，現在子系統卻在神盾局總部，這不得不讓他感到疑惑。
「首領，那是我故意留下的，我們也是靠著人工智慧系統傳遞而來的資料以及情報才能夠維持到現在。」，佐拉博士解釋道。
九頭蛇可以說是這個星球上除了美利堅等頂級大國外最大的勢力，世界各地都有著他的成員，如果不小心謹慎的話，很容易就會被發現。
一旦被發現，那麼迎接佐拉博士的將會是九頭蛇的無盡追殺，九頭蛇可不會放過任何敵人，特別是佐拉博士這種掌握九頭蛇不少資料的人，更是絕對不會放過。
「這段時間辛苦你了，佐拉博士。」，聽到佐拉博士的解釋，葉思雨就感嘆道，他沒有想到自己離開後會發生這麼多的事情。
不過他並不覺得奇怪，他已經猜測這是為什麼，原因就是位面意志出手了。
雖然在美國隊長一的時候，劇情發展和原本的結局沒有多大
