劉肇自一舉掃平了外戚竇氏集團的勢力之後，開始親理政事。他每天早起臨朝，深夜批閱奏章，由每六天一次的大起，改成每日大起，從不荒怠政事，凡事親歷親為。
他深感吏制對大漢王朝的重要性，因而自七月初到臘月底，他下了兩次納賢令。一條條雷厲風行的新政一一出台，很難想像，皆是出於一個十四歲的少年天子之手。
首先他決定封賞劉氏王族。
對於幫助除掉竇憲一族有功的劉慶、劉伉自不必說，賞賜給他們大量的銅錢，絲帛。劉伉本以為自己這次凶多吉少，卻不料因禍得福，只感動得焚香禱告，祈禱漢室平安。
劉肇又封弟弟劉壽當濟北王，劉開當了河間王，劉淑當了城陽王，劉萬歲當了廣宗王，並且將分封各王都留在了雒陽，陪皇伴駕。一樣一來，兄弟和睦，情誼深厚，個個奉公守法，忠心耿耿。
唯一讓劉肇心中難過的就是司空任隗在自己選妃前夕去逝。劉肇大哭了一場，讓任屯厚葬，並在癸丑日，封大司農尹睦為太尉，錄尚書事。
十月己亥，封宗正劉方為司空。下令韓棱徹查所有竇氏黨羽，統統罷官免職。
韓棱也不手軟，深查竇憲一黨，以至於幾個月都休息不好，甚至都沒有時間洗澡。猶如在死灰上又狠狠澆了一桶冰雪水，自此，竇氏一黨已成絕望。
不久，判決下發，太尉宋由被指控為竇氏黨羽，劉肇下策書罷免宋由，宋由因怕被深究，自殺。
中郎將耿夔，由於與竇憲有關係，被免職，封地被剝奪。
已經在永元三年去世的耿秉，他的封地本來由他的兒子耿沖繼承。但是由於和竇憲有關係，封國被撤銷。
這時，已經看清形勢的太傅鄧彪，以年老多病為由請求辭去主管中樞機要的職務。劉肇下詔同意。當然，儘管官員減少了很多，大漢王朝卻從來不缺乏才能之人，由於官員的舉薦，又一批有德有能之人受到了重用。大漢王朝出現了中興之象。
但是這些人中。只有一個人的處決讓劉肇猶豫不定，那就是班固。
竇憲當政的時候，班固投靠了竇憲，成為了他的謀臣和筆臣，竇憲敗亡之後，對於班固的才華，劉肇有扼腕之感。
班固雖然文學修養好，但是對於他的兒子，班固顯然不會教育他們。因此班固的孩子總是仗著是班固之子而在洛陽城裡為非作歹、尋釁滋事，幹了很多違法之事。
很多人都曾向都尉府或洛陽令告發。但是他們卻拿班固的這些孩子沒有辦法，畢竟班固的後面是竇大將軍。
所以很多百姓都咒罵班固，官員們也都班固心懷不滿。
班固不僅對教育自己的兒子毫無辦法，也不約束自己的僕人。有一次，洛陽令種兢乘著自己的小車出行，結果在路上就遇到了班固的家奴。這位家奴喝的醉醺醺的，滿身的酒氣，就在街上耍起了酒瘋，說什麼都不讓種兢的車通過。
種兢見到一個奴才敢擋他洛陽令的路，十分生氣。便命令手下官吏喝令他離開。誰知這人不聽，還破口大罵起來，種兢氣不過，便命令手下人打他一頓。
這時那家奴才慌了神。借著酒醉大罵：「我是班固府上的，你們怎麼敢打我？我要告訴班大人，讓你們吃點苦頭。
種兢一聽這醉酒的奴僕是班固府上的，便氣不打一處來，平時這班固的兒子為非作歹，他接到了多次的告發。卻因為竇憲的原因，只得忍氣吞聲，如今一個小小的奴僕了翹起了尾馬，看來這班固也是一個狐假虎威狗仗人勢的傢伙，真是不可理喻。
種兢正準備收拾他一頓之時，突然想起班固的後台是竇憲，便只好隱忍不發，把那個奴僕趕走了事，但是這件事，種兢卻記在了心裡，想尋機報復班固。
到了永元四年，竇憲被打倒，竇家的賓客也都被逮捕審問。種兢感覺報伊仇的機會來了，他便藉機把班固關起來，進行審問。
班固是一名文學家，也是史學家，他的筆下描寫無數古人冤死獄中，但是他從來沒有想過自己也有這樣的一天。就在種兢的種種拷問之下，或許是有感於周勃被獄吏侮辱的故事，班固死在獄中，時年六十一歲。
一代文學大師，一位品行很端正的大儒，竟然因為自己的兒子和奴僕為非作歹而招人嫉恨，最後
