1月26日馮借出京「巡視」為名，率領1000餘名衛隊，準備赴南京與李純等人商討反段大計。當馮的專車抵達天津時，曹錕率直隸軍政大員在車站歡迎。馮一行人在天津曹家花園小住一夜。曹錕向馮表示：「無論和戰，吾輩堅決服從命令。」第二天，馮國璋繼續乘專車南下，27日下午抵達濟南，山東督軍張懷芝登車晉謁總統，並同車赴蚌埠。此時段祺瑞急電倪嗣沖阻止馮前往南京。
28日上午馮國璋專車抵達蚌埠，倪嗣沖率親信十餘人到站迎接，見到馮劈頭第一句就說：「在天津小站時，咱還是個文官，如今居然也領兵了，咱們多時相好，如今你是大總統，我還是個督軍，天差地遠，我看這督軍覲見大總統的大禮就免了吧！」下車後到了倪嗣沖署府，馮國璋也不甘示弱，剛坐定，就對倪嗣沖說：「督軍不聽中央的命令不必說，就是一個師長、旅長，索餉索械比什麼人都凶，一點點不如意就通電反對中央，請老弟代我想想，這樣的總統做得下去嗎?」倪嗣沖因事前接到段祺瑞密電命令他阻止馮國璋赴南京，所以對馮的態度極為惡劣，他竟然指著馮國璋說：「是戰是和，你是當總統的，總統先有個主意，究竟你的主意何在?你為何不明白說出來！你和段總理已是數十年的老朋友了。可是，現在你只顧自己的總統地位，而不顧總理的面子，此種舉動真令吾輩寒心。」不待馮講話，倪又連珠炮般地發泄內心的不滿：「不知總統是否還記得當年在天津武備學堂當學生時候，校長不是我們安徽的李文忠（李鴻章）嗎。如今安徽人真倒霉了，當年卵翼出來的學生一個個都忘了本，同咱們搗起蛋來，這還了得嗎！」說到此他竟然拍案大哭起來，說什麼：「總統，現在國家已經危險萬分，我們北洋派也到了萬分危險的時候，你看南方的勢力這樣囂張，還有小人在總統跟前挑撥，說你是直派，說段總理是皖派，說你倆鬧意見，現在又造謠言說直皖兩派要分。若真的分了，我們自相水火，那北洋派就完了。」倪的一席話竟使馮國璋也流下了眼淚，跟隨馮國璋的田文烈見此情形，便說：「總統原來是與倪督軍、張督軍諸君商議討伐西南之事呢，既然這樣，待總統回去即下討伐令好了。」馮國璋欲赴南京，倪當即說：「你若回北京，我可以放行，若去南京，我便扣留你在此。」馮國璋不得已，只得折回北京。馮國璋回到北京後，於1月30日下討伐令，派曹錕、張懷芝、張敬堯率軍進犯湖南，並於2月上旬下「罪己布告」說，「上年湖南事起，閣議主張用兵，國璋……冀以武裝促進和平，而未嘗以力征誓於有眾。……長沙陷落，大損國威……正宜申明紀律，激勵戎行……國璋不審傅良佐等之躁率而任用之，是無知人之明也；叛軍幸勝，反議弭兵，國璋輕許之，是無料事之智也。國璋即當返我初服，以謝國人。……」馮國璋效法專制君王用「罪己詔」的形式緩和與段祺瑞一派的緊張關係，盡力向段表示讓步，以平息皖系軍閥政客們的怨氣。3月23日復任段祺瑞為國務總理。
段祺瑞的「武力統一」又占了上風．但馮國璋並不甘心「和平統一」政策的失敗，他密電曹錕率兵南下「適可而止」，不必過於深入為他人效力，「以恢復湘省為止」。曹接電後，心領神會，回電說：「決不令主座為難。盡請放懷！」吳佩孚率直軍攻占長沙後，段電吳「直搗兩廣」，吳藉口餉械供應不及，故意按兵不動。段為了早日完成他的「武力統一」，便極力籠絡曹錕、吳佩孚。當段準備升任曹錕為兩湖巡閱使兼湖北督軍的消息傳出後，馮國璋急忙致電曹錕：「久戎於外，直隸根本之地，未免空虛，倘有疏虞，便無退步。」於是直軍占領衡陽後，曹錕力辭兩湖巡閱使，立即回到天津，吳佩孚亦屯兵不前，並與護法軍劃界停戰，致使段的「武力統一」到此為止。段祺瑞企圖再以名位引誘曹、吳繼續為其賣力，使授曹錕為川粵湘贛四省經略使，授吳佩孚為「孚威將軍」。未幾，段祺瑞又「秘以副總統許曹」。並且親往湖北犒師。馮國璋此時恐怕曹錕再次受騙，便派陸建章赴天津說服曹錕，放棄南征，回到直系與李純等人合作把局面轉向和平。結果陸建章在天津被段的第一親信徐樹錚誘殺。段祺瑞深知阻礙「武力統一」的主要障礙是馮國璋，於是便指使親信王揖唐為首的「安福俱樂部」收買政客，操縱國會選舉，把馮趕下台去。安福系乘馮國璋繼黎元洪總統任期已滿，按照事前段祺
