除了給張居正賜字，隆慶又派了司禮監排名最後一位的秉筆太監陳矩前往高大學士府，在高務實的引薦下，與高拱作了一番懇談。
次日，又有一旨下達高大學士府：「卿輔政秉銓，以朴忠亮直、不避嫌怨，致被浮言，朕已具悉。何乃再疏求退？宜遵前旨，即出輔理，以副朕毗至意，慎毋再辭。」
高拱這一次沒有再堅持，乃出府回閣視事。
然而這次事情註定沒法如此輕易了結，因為就在高拱出府視事的同日，高拱的門生們坐不住了。
吏科給事中塗夢桂劾奏：「尚寶司卿劉奮庸，自以供事舊臣，妄意超擢，乃假建言瀆擾，動搖國是。宜亟賜罷，仍行究治，以為人臣假公營私之戒。」
工科左給事中程文疏言：「輔臣拱竭忠報國，方萬世永賴，不可一日而無。奮庸與曹大野潛構奸謀，頃陷元輔，有乖體罪，不可勝誅。宜示遠竄，或加罷斥。」
兩人的意思大體差不多，認為劉奮庸、曹大埜二人如此輕貶，十分不妥，要直接罷黜，甚至繼續追責。
這個奏疏，當日執筆票擬的張居正沒有做出任何批覆，直接下發到了吏部。
高拱在吏部見了，批覆道：「奮庸嘗供事潛邸，效有勒勞。大埜少年輕銳，亦系言官，未足深咎。請宥奮庸，復大野職。」
這個說法就有意思了：劉奮庸是裕邸舊臣，過去是有功的；曹大埜年輕氣盛，又是言官，就不要深究了，請皇上免除對他們的處罰。
皇上不是希望我和張居正放棄對抗，攜手同心，一力報國麼？行，這兩個人我不僅不追究了，還請皇上給他們官復原職。
疏入，皇帝不許，再次下旨曰：「此曹朋謀誣陷，情罪可惡，宜重治如法。以卿奏，姑從寬。奮庸如前旨，大埜降一級，調外任。」
於是，仍調劉奮庸為湖廣興國知州，曹大埜則吃了虧，再降為正八品的乾州武功縣縣丞，差點貶出官員序列。
張居正對此毫無反應。
日過四月，皇帝病體既無好轉，也無加重，眾臣皆以為皇帝的身子雖弱，但可能也沒有什麼大礙了，只要安心靜養，總會有好轉的時候。
但皇帝自己似乎不肯好好休息，這一日在沒有吏部奏請的情況下，下旨命太常寺卿管國子監祭酒事丁士美，以原官兼翰林院侍讀學士，充東宮侍班官。又命吏部左侍郎兼翰林院學士協理詹事府事張四維掌詹事府事。同時升少詹事兼翰林院侍讀學士掌院事馬自強為詹事，仍兼侍讀學士，協理府事，同教習庶吉士。
張四維前次病休了一段時間，這才剛剛回京，一回京就發現自己莫名其妙的被污衊給高拱送了「八百金」，又是好氣又是好笑——別說高閣老歷來屬意於我，我根本無需做這些蠢事，就算我真要行賄，我是何等身家，高閣老是何等身份，我要送錢是八百金打得住的？
他才剛回吏部當班，就被皇帝小升了一官，不過這也讓他想起自己被誣告的事，於是便以曹大埜疏連污及，上章自辯，因乞解職。
皇帝答覆說，那個事情已經解決了，你不要有思想包袱，趕緊遵旨赴任。
張四維的問題是小問題，他也只是按照慣例來辦，皇帝既然這麼說了，那就不要再繼續矜持了，於是回吏部當班不提。
同日，皇帝還升吏科左給事中宋之韓為刑科都給事中；工科左給事中程文為工科都給事中；禮科右給事中吳文佳為兵科左給事中；工科右給事中宗弘暹為刑科左給事中；刑科給事中陳三謨為吏科右給事中；吏科給事中塗夢桂為戶科右給事中；吏科給事中周良臣為兵科右給事中。
由於這裡面大半都是高拱的門生，外界均認為這是皇帝為進一步安撫高拱而做出的表示。
對於此事，高拱和張居正都沒有直接表示，但僅僅過了兩天，高拱以吏部尚書身份上疏內閣，請調整飭蘇松兵備湖廣按察司副使蔡國熙於山西，提督學政。然後又以內閣首輔身份票擬同意，上呈皇帝。
皇帝見疏，鬆了口氣，覺得自己調和高拱和張居正矛盾這件事，基本應該算是成功了。
隆慶之所以會這麼覺得，是因為他一直認為高拱和張居正矛盾的起點，應該就是從處理徐階松江退田案開
