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不久，平西王吳三桂率十萬大軍從孟津渡過黃河，連破農民軍占據的洛陽、靈寶、襄陽等地，基本上剿滅了李自成在山西、陝西以外的隊伍，收復了河南、湖北等失地。而在半年時間裡，袁文弼在京城裡，除了練就七萬大明禁軍，還很強勢地燒起了中興大明朝的「三把火」。
第一把火，便是建立章法，從制度上徹底杜絕了太監干政，這也是限制明帝的權力，得到了吳三桂等諸王的支持。
宦官干政問題，是明朝政治的一大毒瘤。袁文弼深知，明代太監氣焰囂張，得益於制度：一是太監秉筆，幫皇帝在公文上批紅；二是太監掌握東廠、西廠，監督百官；三是太監外出監軍、監稅、監礦。
袁文弼早就解散了太監掌握的東廠、西廠，派「袁家軍」一千人守衛皇宮，還派滿雲龍率領禁衛軍入宮，在皇極殿前豎起了「禁止太監干政」的鐵牌，鐵牌高一丈，寬六尺，詳細規定了限制太監的章法：「太監不得外出為官，也就是說不再當監軍、監稅、監礦；太監出宮門必須得到軍情處的批准，私出宮門一步者，斬；太監品級不能高過四品；不許結交外官；不許使弟侄親戚暗相交結；不許假弟侄等人名字置買田屋」，規定
但凡犯法干政、竊權納賄、囑託內外衙門、交結官員、越分擅奏外事、上言官吏賢劣者，即行凌遲處死，定不姑貸。
而且，袁文弼還讓明帝下旨，宣布刑部擁有插手太監事務的合法權力，朝臣可以將犯錯的太監「先斬後奏」，也就是說，大臣們可以通過刑部與慎刑司的渠道，把看不順眼的太監直接拉出來殺掉。
而且，袁文弼還改變了明朝的祖制，規定太監要低大臣一等，朝賀大典，內監不得沿明制入班行禮。也就是說，太監不僅不能搶在大臣之前行禮。原來在明朝時，朝臣與太監相見，相互行禮致敬。遇到大太監或者關鍵崗位的太監，朝臣們往往搶先行禮，甚至卑躬屈膝，表示孝敬，內閣大學士也不例外。從袁文弼推行新制度後，完全不同了，規定凡太監與朝臣相遇，不管雙方品級高低，太監都要主動低頭、讓道。若不謹遵，將總管太監一併治罪。而且太監遇到大臣不僅要讓道致敬，也不能直呼大臣的名字。
為了釜底抽薪，袁文弼還嚴限太監讀書認字。明朝宮廷設立內書堂，選十歲上下的小太監二三百人入內讀書。內書堂有專門的老師，教導太監們讀書認字。不少明朝太監書讀得不錯，還留下了不遜於士大夫的詩文作品，政治能力隨之提升，袁文弼認為此舉多餘，太監認識幾個字就可以了，沒有必要讀書。
以禮部尚書錢謙益為首的東林黨，覺得出了心頭的一口惡氣，對袁文弼推行的這些新規定大為讚賞，鼎力支持。反對的幾十位太監，袁文弼還沒動手，就被刑部的官員派人抓起來，凌遲處死！
但袁文弼對東林黨，也沒有多少好感，第二把火，便燒向了他們。因為袁文弼認為，明末的黨爭，也是大明亡國的重要原因。
「風聲、雨聲、讀書聲，聲聲入耳；
家事、國事、天下事、事事關心。」
這是東林黨初創時首領顧憲成撰寫的一副對聯，鐫刻在各地東林書院的大門口。他們胸懷天下的理想和抱負，是可取的，但是他們的能力，袁文弼是懷疑的。東林黨人是好人，所以排擠東林黨人的溫體仁是壞人，這就是《明史》的邏輯。但這種邏輯，騙騙別人還可以，袁文弼卻是不信的。
在袁文弼眼裡，他們就是一群只會讀古書的書呆子，如果在太平盛世，他們的正義感和道德感是值得推崇的，但是，在1644年，正義和道德，是不能當飯吃，不能當衣服穿，更不可能擋住滿清的八旗鐵騎。
袁文弼知道，理想和抱負是一回事，能力又是一回事。當時，東林黨主要以以江南士大夫為主，靠的是在全國各地講學的東林書院籠絡天下讀書人的心，講習之餘，往往諷議朝政，裁量人物，其言論被稱為清議。朝士慕其風者，多遙相應和。東林黨人的書沒白讀，罵功十分了得。不論是市井的歌謠，還是朝堂上直接的上疏彈劾，被盯上的人名聲立馬頂風臭十里，於是，袁文弼就從
第三十一章 中興明朝三把火
