學園都市，擁有著領先當今世界二三十年的科學技術，同時也是超能力的開發場所，這裡有著七位超能力者，每一個人都有擊敗一支軍隊的能力。
學園都市的夜晚也是十分地璀璨美麗，然而就在這樣美好的夜晚之中，卻進行著各種各樣慘無人道的實驗，其中的一個名為「絕對能力者進化實驗」——
經過樹形圖設計者精密演算，學園都市中的七名超能力者中只有排名第一的一方通行有機會進化為lv6的絕對能力者，但是需要二百五十多年的一般課程訓練才能進化為絕對能力者。因為沒有能使人能夠活二百五十年的方法，因此選擇另一種方法：
那就是利用實戰來促進能力的增長，即準備好特定的戰場，讓戰鬥依照計劃進行以掌控「實戰中能力增長」的方向性。根據樹形圖設計者的演算結果，只要準備好一百二十八種戰場將超電磁炮殺害一百二十八次，一方通行便可以進化為lv6的絕對能力者。
但是因為無法準備一百二十八個超電磁炮，所以實驗將目標鎖定在同時期進行的「量產型能力者計劃」中的「妹妹們」，由於量產型的「妹妹們」具有的能力不及其素體超電磁炮的1——也就是level2的程度，因此根據樹形圖設計者的演算結果，只要準備好兩萬種戰場及兩萬名「妹妹們」也可以達到相同的目的。目前，實驗已經進行了10030次，也就是說已經有10030個妹妹已經死去。
而距離第10031次實驗，還有不到一個小時。
「對了，葉子，在這段時間麻煩你拖住御坂，我還是有些不太放心。」從葉子那裡得知，這個實驗不僅僅為了製造出絕對能力者，更是為了讓自己和學園都市第一位的一方通行進行對決，然而明知道是一個陷阱，黑火還是決定參與其中。原因很簡單，他不想讓葉子與美琴再傷心了。
「雖然還是很想吃醋，但是這次我就勉為其難地幫你一把。」葉子裝作有些不滿地「抗議」。
「喂喂……你的傲嬌是從御坂那裡學來的嗎？」黑火看著撅起小嘴的葉子，不禁心癢調戲之。
「還有不到一個小時了哦……」
「好啦好啦，我知道，現在就走，等我回來哦，小葉子~」
看著黑火的影子在夜色之中漸漸消失，葉子輕輕嘆了一口氣，拿起了手機。
此時，常盤台學生宿舍208號房。
御坂美琴在自己的床上滾來滾去，依舊是輾轉反側難以入睡，旁邊的黑子早就已經進入夢鄉，還把自己的枕頭抱得緊緊的，一邊流著口水一邊說著「姐姐大人」，顯然是在做某種春夢。
「不行，還是覺得這種事情要靠自己……雖然白井黑火那個傢伙說他可以有百分之二的可能擊敗一方通行，但是……」這麼想著的美琴換上了自己之前襲擊研究所的那套戰鬥服，準備出門的時候電話卻響了。
「喂喂？我是御坂美琴。」
「御坂同學嗎？我是桐生葉子，想找你有些事情，就在咱們常常見面的公園長椅這裡見面吧。」
「哎？可是我還有事情……」心中突然間閃過一種強烈的不安，美琴下意識想要拒絕。
「就這樣啦……再見。」葉子自然不會讓美琴有時間拒絕自己，見勢不妙，立即就掛斷了電話。
「餵？餵？真是的，桐生同學怎麼也隨便就掛人家的電話啊……」美琴不由嘆了一口氣，「算了，說不定她真的有什麼要緊事……」
此時，在一家廢棄的工廠裡面。
「現在是日本時間八點二十九分十五秒，第10031次實驗即將開始，請問一方通行是否已經做好準備，御坂有禮貌地問道。」這一邊是御坂10031號，依舊是散大的雙瞳與沒有表情的樣子。
「切，被殺了這麼多次，你們難道就沒有一點想法嗎？」這邊就是學園都市第一位的一方通行，由於綽號太過響亮連真名都已經無人知曉了。「御坂不明白一方通行說的『想法』是什麼，qweasdzxc741852963，御坂進行著暗號確認。」
「切……既然你這麼想死，我就滿足你的願望。」一方通行見到御坂10031號對自己的話絲毫沒有反應感到有些惱怒。
「罷了，反正只是人偶而已……」
