每年由馬尼拉開往墨西哥的帆船一艘至四艘不等，每艘載重三百噸至一千噸。
這些馬尼拉帆船，每當六月西南季節風起時啟航北上，在進入北緯三十八度至四十度之間水域後，借西風，向東航行，在距離美洲海岸三四百公里的地方，轉舵南下，直達墨西哥西岸的阿卡普爾科港，航程約需五個月。
後來，移至北緯四十度和四十二度之間的水域，這樣可以利用日本至美洲間由西向東的海流一「黑潮」，加快航程。
從墨西哥回到馬尼拉，則先沿墨西哥西岸南行，到北緯十度和十一度之間海域，借東風西行，經馬里亞納群島(關島)，續航到菲律賓。
航線相對短一些，約需三個月。
阿卡普爾原是一個不過兩百多戶的偏僻小鎮，由於馬尼拉帆船而繁榮起來。
大明的絲綢等貨物一部分行銷墨西哥、秘魯等地，一部分則越過大西洋轉銷西班牙和歐洲其他國家。
馬尼拉帆船從拉丁美洲運回的主要是白銀，到菲律賓後用來購買大明貨物，從而流入大明。
大明一菲律賓—拉丁美洲航線的建立，是西班牙殖民者追求利潤的產物。
同時促進了亞洲和拉丁美洲的聯繫，推動了世界市場的形成。
隨著貿易的發展，移居菲律賓的中國人不斷增多。
西班牙殖民者占領馬尼拉時，當地居住的中國人有一百五十人，幾年後增至三萬人左右。
當時福建、廣東沿海地區特別是泉州、漳州的百姓，紛紛前往呂宋謀生，成為一時熱潮。
泉州安平鎮習俗好行賈，自呂宋交易之路通，浮大海趨利，十家而九。
大明移民多數居住在馬尼拉。
西班牙殖民者規定，在菲律賓的明人不得超過六千人。
這主要出於政治上的考慮，因為西班牙在當地的人口從未超過兩千人，他們害怕明人的增多會對殖民統治不利。
作為一種預防措施，殖民者將馬尼拉明人集中在當地的八連市場。
西班牙殖民者在八連市場對面的城牆上架設大炮，隨時準備鎮壓。
西班牙殖民者出征美洛居強迫二百五十名中國僑民當兵。
這些僑民不堪忍受殖民頭目的虐待，起來反抗，殺死頭目，駕船逃走。
這一事件加深了西班牙殖民者的猜忌。
萬曆三十年(1602)，有個人為了討好奉命採金的宦官，上疏說呂宋的山上出產金豆，可以採取。
明皇帝萬曆下詔，由福建當局派人前去呂宋勘查。
三名使者到了呂宋，被逐回，西班牙殖民者由此更懷疑中國想奪取呂宋，便精心策劃，在第二年九月發起了對明朝僑民的大屠殺，死者二萬五千人。
大屠殺以後，馬尼拉的明人所剩無幾，社會生活的各個方面都發生困難，中國商船停止前往。
西班牙殖民當局為了自身的利益，又設法鼓勵中國人移居。
崇禎十二年(1639)，中國僑民又增至二萬八千人。
殖民者再次感到恐懼，將許多中國人遣送到各地修道士莊園中作勞工，並且加重了捐稅。
中國僑民難以忍受殖民者的壓迫，紛紛起來反抗，但被早有準備的殖民當局用殘酷的手段鎮壓了下去，死亡達兩萬多人。
明朝政府以及崇禎對於西班牙殖民者的暴行，沒有採取任何有力的保護措施。
一方面因為國內社會矛盾尖銳，無暇顧及，自身都難保，如何能對付海外？
另一方面則因為明朝政府一貫把不歸的行為視為觸犯大明刑律。
這些長期僑居國外的百姓在當政者看來都是「奸民」，你們死了活該，當然不會加以保護。
實際上，正是明朝政府這種態度助長了西班牙殖民者的囂張氣焰，畢竟連官府都不管他們，殺就殺了。
而西班牙也算是政府支持的殖民行動。
現在這些逃難的僑民逃回福建後，又求到了賀今朝的頭上。
畢竟賀今朝為了琉球直接擒獲了日本的藩主，順便還在廣東遊街，琉球國國王尚賢大肆宣
