466年9月16日，劉休仁也抵達尋陽，分別派吳喜、張興世進攻荊州，沈懷明進攻郢州，劉亮和寧朔將軍張敬兒進攻雍州，孫超之進攻湘州，沈思仁和任農夫進攻豫章，幾路軍同時出動，平定劉子勛的殘餘力量。
這些殘餘力量已然沒了立足之地，也沒有逆轉乾坤的實力，唯有坐待滅亡罷了。
劉胡逃到石城，被逮捕斬首。
郢州總部行政官張沈，剃光頭髮去當和尚，想藉此逃亡，還是被揭發斬首。
荊州總部行政官劉道憲，聽說濃湖失守，立即遣散州政府軍隊，派人到建康官軍駐所，請求處罰，還未及行動，荊州總務官宗景，率軍進城，誅殺劉道憲，逮捕了臨海王劉子頊，投降。
雍州總部行政官孔道存，派人到建康官軍駐所，請求投降，但聽說劉亮率軍北上的消息，自知難逃一死，於是和三個兒子一同自殺。
湘州總部行政官何慧文，是個文武雙全的將才，劉彧有意讓吳喜傳旨赦免，何慧文說：「我既身陷叛逆集團，親手加害忠義，還有什麼面目見天下之士。」自殺。
安陸王劉子綏、臨海王劉子瑣、邵陵王劉子元，同時接到皇命，一律自殺，劉順和一起逃到荊州的餘黨，全都斬首。
幾方面進展神速，劉休仁很快就從尋陽返回京師，提醒劉彧說：「松滋侯劉子房兄弟，仍在人間，將來長大，恐不是國家之福。」
劉彧深以為然，一不作二不休，於10月1日下詔把松滋侯劉子房、永嘉王劉子仁、始安王劉子真、淮南王劉子孟、南平王劉子產、廬陵王劉子輿、東平王劉子嗣，以及年紀更小尚在乳娘懷中還沒來得及封爵的劉子超和劉子期、劉子悅，全都毒死，並下詔誅殺鎮北將軍府高級軍事參議官路休之、宰相府主任參謀路茂之（這兩人都是路惠男的侄子，可見劉彧恨意之深），兗州督導官劉祗（劉義欣的兒子）和立法院立法官嚴龍，也都遭誅殺，罪名全是叛逆。
劉駿共有28個兒子，本年徹底死光。
大勢所趨，效忠尋陽政權的徐州督導官薛安都、益州督導官蕭惠開、梁州督導官柳元怙、兗州督導官畢眾敬、豫州督導官殷孚、汝南郡長常珍奇，先後派使節向建康歸降。
但劉彧被勝利沖昏了頭，認為西南反軍既已平定，打算向淮北用兵，以炫耀武力，於10月21日，下詔讓鎮軍將軍張永、中央軍事總監沈攸之，率武裝部隊五萬人北上迎接薛安都等人歸降。
中央政府左副行政長官蔡興宗勸劉彧說：「薛安都棄邪歸正，絕對不假，現在只要派一個人手拿一封信，就足夠了，忽然出動重兵，薛安都一定驚疑憂慮，甚至可能招引北方胡虜，災患勢將更深！如果說身為叛逆，罪孽太重，非誅殺不可，可是從前所赦免的人太多，實在不便突然施加重刑。何況薛安都在外據守的是北方最大的一個軍事基地，緊接邊界，地勢險要，兵力強大，無論是包圍或是攻擊，都難以克制，為了國家的利益，尤其應使用和平手段進行安撫，萬一他投降敵國，朝廷將晝夜辛苦去對付外患。」
劉彧拒不接受，對征北將軍府軍政官、南徐州總部行政官蕭道成說：「現在剛好利用薛安都反叛的機會加以討伐，你認為如何？」
蕭道成說：「薛安都十分狡滑，如果用大軍逼他，對國家沒有益處，望陛下三思。」
劉彧說：「各路人馬都是精銳，定能無往不克，我心思已決，你不要多說了。」
蕭道成尋思是你徵求我的意見，不然我才懶得管你那些破事，老劉家果然都是些蠢才。
薛安都聽說朝廷大軍北上的消息，恐懼之下，果然派使節向北魏投降，汝南郡長常珍奇也向北魏投降，獻出郡城懸瓠，二人同時請北魏出兵救援。
薛安都把兒子送到北魏當人質，北魏政府派鎮東大將軍、代郡鮮卑人尉元，鎮東將軍魏郡人孔伯恭，率騎兵一萬人，向東支援彭城，鎮西大將軍西河公拓跋石，以及荊豫南雍三州軍區司令長官張窮奇，向西支援懸瓠，任命薛安都為徐兗等五州軍區司令長官、鎮南大將軍、徐州督導官、封河東公，常珍奇為平南將軍、豫州督導官、封河內公。
劉宋東平郡長申纂，也向北魏申請了投降，但因為名氣遠不如薛安都等人，所以並沒有第一時間得到封賞，於是半道就
