占據長安以後，姚萇一直沒有放棄向周邊擴張，當然也不免遭受敵人的攻擊。
386年7月，前秦平涼郡長金熙和安定民兵司令官沒奕干，與後秦左將軍姚方成，在孫丘谷會戰，後秦戰敗，姚萇讓弟弟、征虜將軍姚緒，擔任京畿衛戍總司令，鎮守長安，自己親率大軍前往安定，與姚方成合擊金熙等人，終於才扭轉戰局。
金熙是東胡人，沒弈干是鮮卑多蘭部落酋長，兩人都是前秦的忠良，實力上也是旗鼓相當，但沒弈干在歷史上更有名氣，人生經歷也更為傳奇，畢竟被女婿害死，可不是每個人都能體驗到的，而且那個女婿還是個臭名昭著的風雲人物。
姚萇的弟弟姚碩德，原本率羌人部落，居住在隴上，聽到姚萇稱帝的消息，於是自稱征西將軍，在冀城招兵買馬，集結民眾響應，任命堂孫姚詳為安遠將軍，據守隴城，族孫姚訓為安西將軍，據守南安，與前秦秦州督導官王統對峙。
姚萇得到消息，便從安定率軍與姚碩德會師，並收降了大批前秦將領，然後任命姚碩德為使持節、隴右軍區司令長官、秦州督導官，鎮守上邽。
苻登率軍一路奪取南安，勢如破竹，直逼姚碩德鎮守的秦州，姚萇唯恐有失，親自率軍來救，與前秦軍隊在胡奴阜會戰，結果遭遇慘敗，死傷二萬多人。
姚萇自恃戰場經驗豐富，而又接連打敗前秦將領，變得驕傲蠻橫，目中無人，結果被名不見經傳的苻登打得落花流水，甚至被敵將啖青一箭射中，被迫到上邽療養，暫由姚碩德接管了所有部眾。
此戰一舉奠定了持續多年的二秦爭鋒的局面，前秦也終於從衰弱中重新崛起，雖然並沒能真正躋身大國之列，但最終延續了皇家祭廟近十年，仍舊功績斐然。
而且苻登肩負一項更為重要的使命，那就是為苻堅報仇，從其結局來看，仿佛他就是為了復仇而生的，一旦姚萇身死，他也走到了人生的盡頭。
苻登的前半生，少有人知，在姚萇稱帝之後，才漸漸進入大眾的視野，而出場之後就執著於一件事，那就是消滅後秦，雖然最後並沒有手刃仇人，但總是加速了姚萇的死亡。
本年11月，苻丕的死訊傳開，苻登改穿喪服，追諡苻丕為哀平皇帝，然後準備迎立從晉陽逃出來的苻懿，大家都勸說：「勃海王雖是先帝的兒子，可是年齡還太小，無力承擔太多災難，而今三個盜匪集團在旁虎視眈眈，應該擁護年長的君主，為了國家大計考慮，大王不應再謙讓。」
苻登於是就在隴東建立高壇，正式登極，改年號為太初，設置文武百官，然後下令在軍營**奉苻堅的牌位，時刻提醒國人這一深仇大恨。
牌位放在一輛四面都有帳幔的祭車上，車用青色車蓋，車前豎立黃旗，由三百名虎賁武士保護，軍中遇到大事決定，苻登一定先向苻堅報告，才去實施。
此時前秦擁兵五萬，將士們的頭盔和鎧甲上，都刻著「死」、「休」二字，意為報仇雪恥，到死方休，有此精神激勵，士卒鬥志昂揚，而每次作戰時，苻登又會特別安排用短劍長矛，布成方圓大陣，然後根據每個戰士的能力，分配戰鬥任務，所以前秦兵力或許並不雄厚，但所到之處，往往旗開得勝。
姚萇幾次挑釁都無功而返，也不再主動出擊，甚至當苻登發動攻擊時，他也避其鋒芒，不予交戰，以守為主，尋找良機。
苻登暫時穩定下來，也不再把主要精力集中在攻城掠地上，而是潛心發展自身實力，做好了持久戰的準備。
長安陷落時，前秦中壘將軍徐嵩和屯墾兵團指揮官胡空，各自聚集武裝部隊五千人，建立堡寨自守，後來迫於壓力接受了後秦的任命，姚萇把苻堅的屍首秘密埋葬在兩個堡寨之間。
得知苻登大軍抵達，徐嵩和胡空不約而同地率部歸降，並把苻堅的屍首掘出，改用天子的禮儀加以安葬，苻登任命徐嵩為雍州督導官，胡空為陪都長安市長，以嘉獎他們對國家的貢獻。
從晉陽出奔的東海王苻纂，仍擁有不少兵力，苻登為了拉攏他，特別派使節前往任命苻纂為使持節、全國各軍區總司令長官、太師、最高指揮官，封魯王，任命苻纂的弟弟苻師奴為撫軍大將軍、并州州長、封朔方公爵。
但苻纂卻不大高興，對使節說：「勃海王是先帝的兒子，南安王
