早在離京之前，唐毅就找到了高拱，進行了一番懇談，新政變法進行了五年，成績斐然，同時也問題多多。
如今內閣之中，高拱年過六十，趙貞吉比他還大得多，另外陳以勤多病體弱，承擔不了繁重的政務，內閣勢必要調整。
再有隨著國策改變，加征商稅，面向海外，政務繁雜程度一下子增加了十倍不止，六部九卿疲於奔命，也難以應付。
新政下一步的重點就是官制調整，唐毅定下兩大主軸，第一內閣權威只能增強，不能減弱，閣老一致原則不變，大學士要保證在五至九個之間，多則紛亂失序，少則專權獨斷。
高拱雖然喜歡攬權，但是操勞了多年，他也知道自己能力的極限，偌大的朝廷，紛繁的內外事務，絕不是他一個人能扛得起來。
至於六部的問題，唐毅希望是進行徹底調整，最好能分成十幾個部門，每個對應一攤。高拱也讚賞這個想法，但是他卻認為難以一下子落實，畢竟六部從周公的時候就存在，綿延兩千年，早已經習慣了，驟然廢除六部，勢必引起所有人的反彈，包括陛下在內。
其實唐毅也清楚，他只是拋磚引玉，見高拱反對，立刻拋出了南北六部合併的設想。原有的框架不變，官職不變，只是把南京養老的虛位變成實際的職務。
高拱左思右想，欣然同意。
當然考慮到會有強烈的反彈，所以唐毅才陪著隆慶南巡，由他擺平皇帝，解決南六部的人選，至於高拱，則是以他的強勢，壓制京城反撲的力量，然後兩個人南北合力，一面裁撤，一面增加，迅速把官制改革這塊硬骨頭給啃下來。
按照計劃，六部尚書變成了十二個，每一部兩個，稱為左右尚書，以左為尊，統領本部事務。所有侍郎平級，不在區分左右，只是承擔具體政務不同。
以戶部為例，左尚書執掌預算、戶籍、田賦，右尚書專職商稅，每人擁有一位侍郎作為副手，另外兩位侍郎分管關稅和工商。
戶部的職能由原本單純的戶籍，稅收，變成制定財政預算，規劃工商發展方向，積極拓展海外經濟，從一個靜態的衙門，變成了富有進取心的戰鬥群體。
兵部大約也是如此，增加了一位尚書，兩位侍郎，原本屬於戶部的軍需部分還給了兵部，左尚書負責制定國防方略，調動兵力，右尚書負責後勤、招兵、選拔武將等等事務，其餘四位侍郎除了協助尚書之外，遇到戰事，要外調總督巡撫，協調戰區事務。這樣一來，兵部成了名副其實的出將入相，權柄變得極重。
吏部除了增加一位尚書之外，同時還拿到了一項至關重要的權力，主持科舉考試的權力落到了吏部頭上。
其實在唐朝的前期，科舉剛剛產生，是由吏部主持考試，後來才落到了禮部頭上，唐毅這一次改制，把這項權力還給了吏部，相應的吏部掌握了從人才選拔，到官職推薦，以及考核評定的全套權柄。
被剝奪了主持科舉權力，那禮部還剩下什麼呢？
唐毅同樣賦予禮部兩項極重的權柄，第一是在全國範圍內，推行教育，廣設學校，按照唐毅的設想，要在十年之內，使大明的識字率達到百分之三十。
聽起來貌似不高，其實是相當嚇人的，眼下大明識字率不足百分之十，東南除了蘇州，杭州，紹興等寥寥幾府，都沒有超過百分之二十的，一口氣要把全國提到百分之三十，這是何等的雄心！
唐毅計劃在隆慶六年，就撥給禮部三百五十萬辦學經費，在三年之內，達到一千萬元，超過吏部的俸祿支出。
除了辦學之外，還有一項，就是對外交往，文化輸出，向藩國宣講孔孟之道，吸收外國學子，說穿了，就是制度輸出。
有了這兩項權力之後，禮部也懶得主持考試了，要滿世界跑，到處建學校，還要跑到海外折騰，哪裡能有功夫？
只剩下工部和刑部，這兩個衙門相對專業，只是大工程越來越多，城市越來越繁榮，原本在農村，很多紛爭族老前輩就給解決了，到了城市，必須由朝廷出面，相應的工部和刑部的事務也就多了起來。
唐毅帶著隆慶，考察了蘇州好幾個縣的情況，無一例外，蘇州的編外人員超乎想像，六房書吏當中，人數最多的戶房竟然要二三十人，下面還有一大堆的辦事差役，非如此不能徵收稅負。
要想讓馬兒跑，就要給馬兒吃草。
想要商稅之利，就要有足夠的官吏，把繁重的任務扛起來。商稅可不同田賦，一年到頭，田賦就夏秋兩次，十分容易，可是商稅呢，幾乎無時不刻都在發生，稍微疏忽，就征不到稅收。
隆慶詢問各地，情況也都差不多，他欣然同意了唐毅的建議，先合併六部，進而從上到下，增加官員數目，真正把責任扛起來……
&真沒想到，陛下竟是如此從善如流啊！」茅坤感嘆一聲，他這一次提前到東南，就準備著發動各方的力量，隆慶敢不點頭，就展開全面攻勢，無論如何，也要一錘定音。
哪知道什麼都沒用，光是唐毅帶著隆慶轉一轉，講講情況，皇帝就照單全收。而且給的比想像還多。
甚至隆慶還到處留下御筆，酒樓得到了，鳳洲酒的作坊也得到了，
一國之君，給商人題字，這是千古未有的恩惠，農商皆本的主張，越發深入人心。
&夫承認，我錯看了陛下，他是真正的大智若愚，假使陛下能再活十年，大人繼續柄政，說不定可以兵不血刃，實現我們的預想。」
茅坤等人聚集在唐毅手下，所求的無非就是限制皇權，跳出興衰治亂的怪圈。
&要這一次改制成功，我們的目標也就完成了大半！」唐毅深深吸口氣，欣慰道：「原本內廷的實力就不及外廷，如今南北六部合併，官員的力量徹底整合到一起，哪怕是陛下，也無非扭轉整個文官系統的意志。」
眼看著心想事成，唐毅卻沒有太多的喜悅，「鹿門先生，我利用陛下的信任，一步步走到今天，早就把他的江山弄得零零落落，大權旁落，真不知道，該如何面對陛下啊！」
茅坤陪笑道：「大人，陛下之仁慈寬宏，的確古之罕有，他多在位一天，就是我們的運氣，大人可要盡力保駕護航才是。」
唐毅點頭，「我知道了，等我把南方的事務處理完畢，立刻護送陛下回京，馮保那個惡奴，還有李貴妃那個潑婦，我都不會放過！別以為他們暗中縱容陛下沉浸女色，戕害陛下血脈的那些醜事，我一點不知道！從今往後，我斷不允許他們傷害陛下一絲一毫！」
或許真應了那句話，傻人有傻福。
隆慶的孱弱敦厚，竟然換來了唐毅久違的感動，他都不忍心再算計可憐的皇帝陛下了。
接下來的日子，唐毅全力處理南六部撤銷的事情，他又安排專人，陪同隆慶到了松
