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隨著古河公方公開向小笠原輝長投降，關東大震，一部分國人和豪族準備隔岸觀火了。一筆閣 www.yibige.com
位於常陸的佐竹家，上總的真里谷家（武田家）紛紛派出使者跟小笠原輝長聯繫，輝長直接就答應了。
當然，輝長知道這些國人靠不住，當然是要他們交出人質的，而且，最重要的是他得擊敗上杉輝虎的大軍，才能讓那些關東國人認可他。
可惜小笠原輝長沒有把握在野戰中擊敗上杉輝虎，哪怕是武田晴信，已經有天下人之資的織田信長在野戰之中被上杉輝虎擊敗。
哪怕是相模之獅北條氏康也只能依託城池之利與上杉輝虎對抗。
而且按照現有的局勢，小笠原輝長沒必要急著去與上杉輝虎交戰，他完全可以慢慢的調略武藏下野等地的國人。
上杉輝虎是一個點歪了屬性點的主君，野戰無敵的他，攻城幾乎沒贏過，內政勉勉強強，所以，時間拖下去對於小笠原輝長是很有利的事情。
到了七月，小笠原輝長下達了一個新的命令，那就是一國一城令。
這個指令一下達，新收復的遠江、駿河、伊豆三國影響很大，相模的北條家、安房的里見家、常陸的佐竹家等大為震動。
損失最大的就是各地的國人和豪族，他們必須得住進守護的居城裡，這樣就減少了大量的割據勢力，內部鬥爭都局限在了守護的居城裡。
在一國（此處的「國」是指令制國，或大名的領國（之後的藩））中，由大名所居住作為政廳所在的城只能保留一個，其餘的城必須全部廢除，但需要注意的是被廢棄的城池大多是鎌倉幕府時期修建的具有軍事防禦功能的山城。
各大名為了確立對家臣的支配管理，將家臣們自主修築的城池廢棄掉，讓家臣們向大名自己修築的城內集中。
到了此時，城池不再單單是一個軍事據點，而是政治據點與大名權威、權力的象徵。
於此同時，因為城池成為領國內的經濟中心，所以商人和手工業者也紛紛向此聚集，這樣便形成了城下町。
在一個令制國由複數的大名分割領有的情形下，各大名各有一城。
一個大名家領有複數的令制國時，領有的各令制國各有一城。
此一法制並非一刀切的實施，而是有彈性的運用。
比如井伊家對於小笠原輝長平定今川家有大功，所以決定留下他們家的居城。
按照一國一城令，令制國內有數個大名，則二十萬石以上的才能建造居城，其餘不足二十萬石的大名都將居住於守護居城內。
按照小笠原輝長的規定，小笠原家內的家臣並沒有哪一個是有二十萬石的，基本都是萬石左右。
所以按照一國一城令，他的家臣們都得居住於他規定的居城內。
如，美濃國內，家臣們都必須廢掉居城，全部搬遷到稻葉山城居住，至於他們的領地內務都將交給家臣團處理。
家臣團在領地里不能修建城池，只能修建陣屋或是莊園，防禦力並不高，但是可以防禦山賊暴民等。
為了防止家臣起異心，小笠原輝長設立了三大佬九奉行共十二人的頂層家臣團。
三大佬為各個家臣家中的譜代重臣擔任，每一位大佬可以管理三個奉行，商議事情由其十二人表決，不過三大佬的票數為九票，也就是一人三票。
這九位奉行因為事物分為外務奉行、內務奉行、武奉行、禮奉行、吏奉行、工奉行、商奉行、刑奉行、治安奉行。
外務奉行主管外交事宜，主要是與朝廷和幕府之間的聯絡，內務奉行就是指管理領國內部事務的，包括行政事務。
武奉行主管武士、足輕的安排等事情，同時還有考核武士武藝的職責，當幕府有戰事徵召時由武奉行與幕府對接。
禮奉行主管家內禮儀以及武士文化類考核。吏奉行安排家內武士在家中的任職，其餘九位奉行里的官吏皆由吏奉行推舉給三大佬。
工奉行主管國內建設，包括基礎建設和民事建設，
