哪怕尼奧變身成為了救世主，整個故事也沒有因此崩潰掉，因為他還有自己的老對手史密斯特工也進化了！
前面部分幾萬隻密密麻麻的機械烏賊圍攻錫安的震撼場景讓在場的觀眾們久久不能忘記，可是一波未平一波又起！
眼下為了找到關鍵人物開鎖匠，尼奧找到了矩陣中另外一個古老的程序梅羅紋加，並且跟他大戰一場。 .
緊接著故事就分成了兩邊，這邊尼奧對戰梅羅紋加，兩人在樓梯處大打出手，看起來精彩絕倫！
而另外一邊的效果更佳震撼，梅羅紋加手下最邪惡的雙子幽靈追蹤墨菲斯等人來到高速公路，女主角崔妮蒂帶著開鎖匠跳上了一輛裝有摩托車的運輸車，並且在這輛摩托車上面跟矩陣特工、雙子幽靈展開激烈的追逐戰。
這一場看起來絲毫不可能編排成功的超級追車大戲看起來熱血沸騰，崔妮蒂更是帥破天際，表現得十分搶眼！
長達十多分鐘的汽車追逐戰外加打鬥場景讓人腎上腺素急速飆升，而且絲毫感覺不到設計痕跡，所有人都沉浸在林翰編織出來的澎湃激情當中！
不光視聽效果炸裂，林翰還展現出了一種獨特的視覺通感，唯美的分鏡頭巧妙捕捉了事物、人物的瞬間心態，使得那一刻看起來非常不可思議又耀眼異常，這種誇張而有趣的處理手法讓那個影評人讚嘆不已，很多人都不由自主的想到了日本動漫裡面類似的鏡頭。
林翰藉助視覺特效，竟然拍出了最具動漫風格精髓的真人電影！
故事發展得很快，當開鎖匠帶領尼奧和墨菲斯走進程序員通道後，陰魂不散而又無處不在的史密斯特工再度出現。
最終開鎖匠犧牲了自己，終於打開了通往源程序的大門，尼奧進入了這個神秘的地方，見到了矩陣的設計師！
這裡沒有精彩的打鬥，也沒有太過於炫酷的特效，有的僅僅是聊天。
可影評人們恰恰卻關注的就是這些內容，林翰已經證明了他對打鬥、槍戰、追擊等戲份的掌控能力，現在文戲上面依然無比強悍。
電影不可能一直都突突突的槍戰，噼里啪啦的打鬥，蹦蹦蹦的爆炸，有時候這種舒緩的節奏跟能讓人陷入沉思！
「這設計師的話是什麼意思？每一代都有尼奧，難道尼奧也是一個np？」
「小說這裡都有點沒看懂，電影說得清楚點。」
「錫安難道不是一個真實的城市？」
「之前那個先知神婆也不是人類，是一段系統程序，尼奧也不是人類就好接受得多。」
「我終於明白了，原來尼奧跟錫安都是系統升級用的測試平台，他是母體裡面無數不可避免的異常程序的集合體，他就相當於是一個bug！而系統也知道尼奧這個bug是不可避免的，反而利用bug進行系統升級。每一代的尼奧最終都會走回代碼之源，幫助機器完成升級。那為什麼這一代的尼奧與眾不同呢？」
「故事到了這裡總算是有了深度，前面那些是標準的爆米花電影。」
「林翰可以啊，這段文戲拍得太棒了！」
影評人都忍不住竊竊私語起來，他們彼此之間的小聲交談傳到林翰的耳朵裡面，讓他差點歡呼雀躍起來。
其實對於《黑客帝國2》的劇本，林翰是做了相當多刪改的，因為原本沃卓斯基兄弟的《黑客帝國2：重裝上陣》遭遇了失敗，被很多人認為是三部曲裡面最糟糕的一部！
不光故事冗長拖沓，情節上面也混亂不堪，出場人物眾多，表演誇張，大量情節可有可無，很多人看完這一部之後都是一頭霧水，不知道導演想要表達些什麼。
雖然整部電影思想很精彩，但對觀眾太不友好了，一大堆沒必要出場的人說了一大堆沒營養的話，很多人話關係交代不清，觀眾還沒記住他們的長相呢，結果人就不見了！
演員們的表演顯得非常浮躁，太過於戲劇化，像是在演舞台劇一樣，完全吸引不了人，讓人覺得有些出戲。
因此林翰在拍攝自己這個版本的時候，就吸取了教訓，將很多可有可無的配角線索刪掉或者減少戲份，讓故事變得流暢起來，情節簡單了，觀眾們看起來自然就不會累，所以才很
