當小櫻、當麻、土御門、神裂、米夏在學園都市內「兜圈子」的期間——
美琴得知菲布理是人造人，之後小櫻和其他妹妹又被「上級」叫去做「黑暗」的工作，拜託大家照顧菲布理後，美琴心中那個恨啊，已經難以隱藏在心裡了，連朋友們都看出了她的狀態不對。
經過自我心理的激烈鬥爭和朋友們的勸告後，美琴約了還不知道真相的黑子、初春和淚子，向她們坦白了實情。雖然大家的樣子變了，可認知沒變，所以完全無礙。
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&布理，和美琴學姐的妹妹們……都是人工製造的？」
&警備員也無法出手，真的存在這樣的組織嗎？而且連美琴學姐的妹妹們都是這種組織的人…………」
&布理沒有那糖就活不下去什麼的…………」
&想琴說道，「之前我為了妹妹們的事情，和她們接觸過，是群非常危險的人，結果，我什麼也沒做成，最後還是靠妹妹們才擺平了事情，後來的『幻想御手』、『亂雜開放』事件也是，我真是個沒用的姐姐，不是嗎？
&布理的話，現在雖然有克洛伊的投影幫忙維持，但只能確認構成，製造方法卻不詳，並非長久之計，要救菲布理，就必須置身於如此危險之中。希望你們了解這點，說實話我不希望大家涉險，老實說，我不知道能否保護好大家…………」
不過美琴也只承認了已經認識的五個妹妹，兩萬個怎麼說都太駭人聽聞了？令美琴始料未及的是，大家馬上就開始討論起應對暗部的策略來了。美琴對此非常感動。
之後，初春和淚子前往風紀委員支部做進一步調查，美琴和黑子則到警備員那裡了解一些情況——
&要那些驅動鎧和警備機器人，以及要見見上次抓到的犯人嗎？」黃泉川說道。
&要了解一些情況。」黑子說道。
&歉，東西都被上級收走了，犯人也因為沒有證據，又迫於上級壓力無罪釋放了。」黃泉川嘆氣道。
&但是，有了這麼多證據，怎麼會無罪？」黑子不敢相信。
&些機械都沒有電子系統，收繳的計算機也是一啟動就被自動清空了數據，被擺了一道啊。嘛，那邊肆意妄為也不是一兩天了，我們不是沒調查，但幾乎一無所獲。」
最後，美琴和黑子只從黃泉川那裡得到了一個裝有絲狀物的零件作為線索。給冥土追魂分析後，得知是菲布理相同個體的頭髮，但沒有進一步線索了。
無奈，在託了冥土追魂的關係後，美琴見到了正在被監禁的泰瑞絲緹娜。在一番捨棄尊嚴的死纏爛打後，得知了「生化智能（chemical-roid）計劃」和該事件和學究會有關的事實。
根據該線索，初春查到了暗部「stndy」成員的部分嫌疑人，以及「studycorporation」，包括其在第十七學區的工廠的地址。
調查到此，一天已經過去，美琴決定次日親自去這個工廠進行調查，畢竟這是現在唯一的線索。
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深夜，視線轉到，御坂櫻視角——
白天對當麻的老師同學的調查無果，天色暗下來後，便準備各自回到落腳點或公寓了，畢竟有些事太急也無法完成。
但是，過了大約午夜，神裂和土御門卻再次被小櫻召集到了大眾餐廳。
&坂小姐，你叫我們來有是什麼新發現嗎？」神裂很認真地問道，雖然小櫻的表現一直以來都是對魔法一知半解的樣子，但從拯救茵蒂克絲的表現看，小櫻的話還是很值得一聽的。
&前說過，天使墜落的副作用只有施術者本人才不受影響，是吧？御坂櫻在此確認。」
土御門和神裂點點頭。
&們在市內調查的同時，為了提高效率，我讓妹妹們去調查了一下上條同學的家人（黑客技術查找戶口信息並黑掉學園都市外圍防禦系統後實地走訪），發現只有他的父親樣子完全沒變（照片比對）。御坂櫻在此告知。」
&的意思是說，阿上的父親就是施術者喵？」土御門道。
&題是，上條同學也說過，他的父親上條刀夜是普通人。但是，當初救茵蒂克絲那段時間，我和上條討
第六十二章 御坂姐妹偵探秀
