在眾人商討營救墨菲斯的計劃期間，坦克終於醒了過來，在了解了墨菲斯被捕的情況後，坦克不顧自己的傷勢，執意要參與到任務中。在巨大的壓力之下，眾人也不矯情，欣然答應。這樣一來，原本被安排需要和道瑟一起留守尼布甲尼撒號，負責眾人退路的蘇薇琪便解放了出來，營救行動隊又增添了一名寶貴戰力。
至於茂史，眾人也在第一時間從甦醒的坦克口中得到了和道瑟闡述的一樣的信息，眾人恍然大悟，怪不得茂史當時明明置於絕境，卻能第一個毫髮無傷的回歸，再聯想到姍姍來遲的特工布朗，以及茂史回歸後的襲擊行為，這下徹底坐實了茂史的背叛行為，眾人對此不再有絲毫的異議。如此一般，自然也不會有人再理會這個叛徒。
而茂史最終也沒能撐到墨菲斯歸來，終因傷勢過重而死，至死連個解釋都沒有。
不過這些都是後話。現階段，與其為了搞清楚茂史反叛的緣由而浪費時間，不如把營救計劃做的再細緻一些。畢竟營救墨菲斯才是尼布甲尼撒號的首要任務。
在眾人的通力合作下，營救計劃修訂完畢，撤退路線安排妥當，全體人員各就就位。
墨菲斯營救計劃正式啟動。
伴隨著刺耳的電話鈴音，尼布甲尼撒號的現有的五名戰鬥人員悉數進入了矩陣世界，隨之而來的是大量輕重武器。
行動隊分為三組，尼奧和崔妮蒂負責正面佯攻；蘇薇琪此次沒有和艾巴一組，而是和斯巴克一路，負責營救任務；射術最為精湛的艾巴則獨自行動，負責遠程的火力支援。
三路人馬在武裝完畢後，迅速開始分頭行動，很快就抵達了預定位置。
在確認各組就位後，首先與對方接觸的是尼奧二人。
只見身著一身黑色勁裝的二人，攜帶大量致命的武器若無其事的走進關押墨菲斯的大樓，在對方安檢人員目瞪口呆之際，拉開了戰鬥的序幕。
屠殺一直在持續，雖然眾人和特工有著不小的差距，但對上矩陣中的未覺醒者，卻是易如反掌。尤其是尼奧，即使是對方派遣了眾多精銳的安保人員前來阻擊他，也收效甚微。兩人在將一樓所有人員屠殺一空後，走進了升降梯，不久後引爆了一樓的烈性液體炸彈。
劇烈的爆炸摧毀了大廈的電力系統，同時也吸引了特工的注意，布朗和瓊斯迅速前往查探，留下史密斯一人獨自看押墨菲斯。
趁著這個空隙，從墨菲斯所在房間背向的大樓，通過錨鉤發射器滑落到樓頂的二人，短時間裡內順利奪取了停留在樓頂負責巡邏的武裝直升機。
蘇薇琪在和道瑟聯繫獲取了直升機的駕駛程序後，載著斯巴克飛向了墨菲斯所在的房間。
當操控著M134型速射機槍的斯巴克出現在史密斯視線中的時候，憤怒的後者急速拔槍向斯巴克開槍射擊，同時向墨菲斯靠攏，試圖以此為要挾，讓其投鼠忌器。
然而，斯巴克並不準備給史密斯這樣的機會，長長的火舌驟然噴出。斯巴克用子彈形成的壁壘將房間內的兩人隔開。同時不斷壓縮史密斯的行動範圍，在後者走投無路之際，用一連串的子彈結果了對方。
停止射擊的斯巴克大聲呼喚墨菲斯的名字，意圖讓其重新振作。
墨菲斯，無愧於尼布甲尼撒號的艦長，憑藉其驚人的意志力，頑強的站了起來。他掙脫了鎖拷的束縛，開始步履蹣跚向直升機走去。
因為藥物的作用還在持續，墨菲斯的狀況並不好，蘇薇琪不得不將直升機進一步向大樓靠攏。
「太慢了，時間耽誤的太久了。」斯巴克這樣想著，手上不禁暗暗捏了把汗。
果不其然，被尼奧用調虎離山之計引開的兩名特工在此時返回了。
這一次，由於墨菲斯的位置不佳，斯巴克沒敢再次開槍。但是。斯巴克不敢，不代表艾巴不會採取行動。
一把精準度極高的AWP狙擊步槍，足以讓射術精湛的艾巴化身死神。
由於布朗所有的注意力都被斯巴克和墨菲斯吸引，所以他恥辱的再度被艾巴一槍帶走。
雖然射殺了布朗，但艾巴也只能到此為止了。瓊斯抓住這短暫的機會，迅速移動到墨菲斯的身後，以墨菲斯的身體為屏障，阻擋了艾巴的射擊角度，同時，向墨菲斯射
