在《補天》中，女媧甚至都沒有出場，一切都是人間的故事。
某年某月某日，金陵的天上出現一個白色的光圈，隨後就是淫雨霏霏，幾月不開。
光圈剛開始出現的時候，金陵的人覺得是祥瑞，就舉行很大的儀式來慶祝這個祥瑞，人們每天出門都會看向頭頂的光圈，覺得自己得到了神靈庇佑，金陵城到處都充滿了快活的氣息。
幾天之後，開始下雨。
但是金陵人沒當回事，金陵隔幾天就要下個雨，不下雨才怪咧。
一直到雨下了十幾天都沒有要停的跡象時，人們才感覺到不對勁。
這時候有人說，雨是從那個光圈裡面出來的。
原本人們沒往這方面想，但是一旦聽了這個說法後，他們再抬頭看天上的光圈時，就越來越覺得有道理。
雨肯定就是從光圈裡面出來的。
又有人說，天漏了窟窿，那個光圈就是窟窿。
人們又很快接受了這個說法，但是人們也疑惑，為什麼窟窿裡面會漏水，照理說，要是漏了個洞，天上的星辰應該掉下來才對。
也有人說，天不止一層，天上還有天，天有三十三層，現在破掉的就是第一層，那些星辰不在第一層，第一層裡面只有天河，現在下的雨都是天河裡面的水。
不過很快，金陵人就沒有心思去想這些問題了，因為雨越來越大，金陵城已經被淹了很多地方。
莊稼沒了，蔬菜水果也都沒了，金陵的人開始死去，以各種各樣的方式。
有些淹死的，更多是餓死的，屍體沒人處理，只能飄在水上。
平民們跑不了，只能每天跪在地上祈天，達官貴人們則分成了兩派。
一派人選擇了在金陵還沒有淹掉的時候就攜帶著財產往西邊遷移，找更高的地方居住，他們認為天河的水不可能沒有流乾的那天，他們只要找到地勢高的地方就能安然無恙。
另一派人認為天河的水無窮無盡，逃到哪裡去都沒用，所以他們準備弄很多艘大船結成一個船陣，儘量地搜刮糧食和種子，就算大地都被水淹了，他們都可以在船上生活。
但是金陵的糧食就那麼多，第一派和第二派就有了矛盾。第二派為了不讓第一派把糧食帶走，就發起了進攻，一場大戰之後，第二派獲得了慘痛的勝利。
勝利之後，第二派不停地造船找船，光圈出現半年之後，他們終於湊夠了一百零五條船。
這些大大小小的船裝滿了糧食、種子、牲畜、泥土……它們被拖在岸上，用粗大的鐵鏈連在了一起，成了一個龐大的船群。
達官貴人們又覺得需要一些僕人和工人，就向外界招募，想要上船需要通過重重審核，最基礎的一點就是要帶三十斤大米，或者其他差不過份量的糧食。
也有些被「特招」進去的，比如有些女子長得好看，有的人會掌舵，有的人會做飯，有的人會唱戲，有的人會彈琴……
反正只要是具有貴族們看中的特質，就能被「特招」上船。
而且貴族們為了自己在船上能夠過得更好，同時制定了一系列的「法律」，也為船上的人劃分了等級。
等級決定了每日糧食的配額和能享受的權利，如果等級太低，最終只會被扔下船。
扔人下船是為了控制人口，制定這些法律的人認為這個做法是「未雨綢繆」。
但是當一切準備就緒，貴族們開始率先登船的時候，一塊巨石從天上掉了下來。
當時，貴族們正在組織會議，忽然有人看到天上有一個小點，起初不以為意，後來小點越來越大，那人就驚叫起來。
船上亂了起來，極少數人跑了，但是大部分人甚至還沒來得及想著跑，巨石就砸向了他們。
一瞬間，一百零五條船就消失在石頭下面。
巨石在地上砸了一個大坑，又彈起來在旁邊立著。
大坑周圍的水慢慢地朝坑裡面流去，天上的雨也停了下來，沒用多久，太陽出來，金陵的水慢慢退去。
……
《補天》的主視角是一個十幾歲的船工學徒，一開始他靠著幫貴族造船得到
