楊順大怒，於是遣手下在嚴世蕃面前告狀：」沈煉自被貶後，私下結交死士、習騎射；沈煉拔劍起舞，劍勢有黃布如蓋，從空飛來，其『居心叵測』十分可疑！「嚴世蕃遂讓巡按御史李鳳毛負責追查。筆神閣 www.bishenge.com李鳳毛看不慣奸相嚴嵩「結黨營私」的行為，來了個「和稀泥」曰：「經查確有此事，然而沈煉已解散其黨羽，建議此事就此作罷。」
嚴世蕃也不笨，聽出李鳳毛是在敷衍自己，於是將李鳳毛罷官，用屬於嚴嵩一黨的路楷來代替李鳳毛出任巡撫御史。嚴世蕃特地命路楷與楊順共同合計陷害沈煉的事，還特地允諾事成之後，給他們豐厚的報酬。兩人於是日夜合謀怎樣陷害沈煉。
當時，蔚州（今蔚縣）妖人閻浩等素來以白蓮教惑眾，出入漠北，泄邊情為患。官軍捕獲閻浩，閻浩的供詞牽連了很多人。楊順眼珠一轉，笑著對路楷曰：「閻浩的這件事，就是我們一直等待的，報答嚴公子的機會啊！」於是，楊順與閻浩竄供，將沈煉的名字列在反賊名單中，誣告閻浩等拜沈煉為師，聽其指揮，將沈煉關押入獄。楊順兵分兩路，一邊派人給嚴嵩父子報信，一邊向兵部上奏請求處斬沈煉。
沈煉知道自己這次是「在劫難逃「了，於是他給自己的兒子寫了封遺書：《給子襄書》
范仲淹做秀才時，即以天下事自任。況今南北告警，旱魃連年，天變人災，四方迭見，當此之時，不可為無事矣！汝等不能出一言，道一策，以為朝廷國家；只知尋章摘句，雍容於禮度之間，答謂責任不在於我。因循歲月，時至而不為，事失而胥溺，則汝等平生之所學者，更亦何益！南方風氣秀拔，豈無雄俊才傑之士邪！吾願汝親之敬之。其阿庸無識之徒，願汝疏之遠之。
天降烈禍，殿廷灰燼，旬日之內，宮殿繼燒。此乃賊臣擅權肆惡，以致陰陽失節，而禍固起於朝廷，土木大興，而害則延於百姓矣。宣大臣僚，與敵通和，私相納賄，無復人理。吾以中心耿郁，有事必直言於當道，彼等亦稍畏縮，但廊廟之中，欺君之計通行，而鬻官之聲大震，不能不動汝父之憂耳。
嚴嵩父子得信後大喜，之前在宣大作總督的許論，此時執掌兵部，竟同意了楊順的奏請；嘉靖三十六年九月沈煉被處斬於宣府，沈煉兒子沈襄被發配邊關。可憐沈煉本是個文、武全能的難得才俊，竟然被奸黨慘害而死，沈煉死前在《青霞集·卷十二》表明心跡曰：「夫庸將薰染成風，其心術大壞，譬如牙胥之不可責，其廉潔倡家之不可導，以死節也。誠能一朝議成著為憲令，舉明忠義之道，風於四方，示之以利害。道之以悃誠。「
徐渭與沈煉感情最深，為了紀念沈煉，徐渭在《與諸士友祭沈君文》中寫道：「主仁臣直，父忠子孝，所系綱常，豈直光曜，聚哭傾里，朗誦哀章，將以激懦，匪以悼亡「；後來徐渭為了抒發自己對沈煉思念、敬佩的感情，又親自編排了《陰罵曹》，將嚴嵩代入成曹操、剛直敢言的彌衡則象徵著沈煉。
後來，嚴嵩父子獎楊順一子為錦衣衛千戶，路楷也像坐了直升飛機一樣，從七品官一下提升到了五品卿寺。面對嚴嵩父子的」論功行賞「，楊順仍然很不滿意，他對路楷曰：「嚴公拿這麼微薄的賞賜給我，是不是不滿意我們的行為啊？看來還要多做點事情才行！」於是，楊順、路楷對沈煉之子沈袞、沈褒行了毒手，將他們杖殺，更派出移文到邊境去逮捕沈襄。也許是天佑忠良，楊順、路楷因為多行不義之事，犯了別的事情被朝廷免職，沈襄這才保了一條命。
楊順、路楷等人的落馬，昭示了一個跡象，那就是嘉靖皇帝對嚴嵩的行為越來越看不順眼，已經著手開始對付他們了。
原來嚴嵩握權日久，遍引黨羽居於朝堂要害之地。嘉靖皇帝漸生厭惡之心，於是漸漸親近徐階。徐階一黨的吳時來、張翀、董傳策各自上疏彈劾嚴嵩，嚴嵩秘密追究吳時來、張翀、董傳策上疏背後的主使者，把他們下到詔獄裡拷問，然而這幾個人生死不屈，嘉靖皇帝雖然沒有追問這件事，以示安慰嚴嵩之意，然而嘉靖皇帝內心已經有所觸動，徐階也因此事而得罪了嚴嵩。
當時，吏部尚書之職空缺，嚴嵩極力引薦歐陽必進出任此職，然而剛剛任職三月，歐陽必進就被嘉靖皇帝斥退；」禍不單行「，繼吏部尚書歐陽必進出事之後，嚴
